Con una especialización en estudios de Genómica de cáncer.
- Análisis de SNP en genoma completo
- Análisis de SNP en exoma
- mRNA
- miRNA
- lncRNA
- circ-RNA
- Perfil taxonómico basado en 16S
- Perfil taxonómico basado en 18S
- Perfil taxonómico basado en ITS
- Perfil taxonómico y perfil funcional usando aproximaciones de metagenómica shotgun
- repertorio TCR
- repertorio BCR
- Tipaje genómico HLA
- con illumina
- con PacBio
Trabajamos con todo tipo de muestras de cualquier tipo de organismo. El laboratorio de genómica de Genome7 está acredidato como Laboratorio P3 (nivel 3 de seguridad biológica).
Realizamos servicios de secuenciación masiva (NGS) y de análisis bioinformático para cualquier tipo de organismo:
- con illumina
- con PacBio
- Ensamblaje de novo y anotación funcional de genes
- Análisis de SNPs en todo el genoma (alineando las reads al genoma de referencia) con analysis filogenético
El ensamblaje de novo con PacBio permite obtener genomas completamente cerrados (el cromosoma en un sólo contig y cada plásmido en un sólo contig).
Tener un ensamblaje de la máxima calidad facilita obtener también una anotación al más alto nivel de completitud.
- Análisis del impacto funcional de los SNPs detectados en un grupo de aislados
- Análisis filogenómico
- Comparación de genomas basada en el alineamiento de los genomas enteros
- Tabla de ortólogos
- Perfil taxonómico basado en 16S
- Perfil taxonómico basado en 18S
- Perfil taxonómico basado en ITS
- Perfil taxonómico y perfil funcional utilizando aproximaciones de metagenómica shotgun
- Perfil taxonómico basado en 16S
- Perfil taxonómico basado en 18S
- Perfil taxonómico basado en ITS
- Perfil taxonómico y perfil funcional basado en aproximaciones de metagenómica shotgun
- con illumina
- con PacBio
Estos tipos de análisis del microbioma pueden aplicarse para el análisis de la composición alimentos, el estudio de la rizosfera de planstas (uso de micorrizas en la mejora de cultivos) o para la detección de patógenos en plantas, animales o alimentos. En la producción de alimentos que incluyen fermentaciones (queso, vino, cerveza, pan) el análisis del microbioma puede ayudar en la optimización de la eficiencia en la producción. Otras aplicaciones de la secuenciación masiva en el sector agrifood están basadas en el genotipado para la selección de características ventajosas (mejora de plantas de cultivo y de animales en ganadería)
Ofrecemos servicios de secuenciación masiva para el sector de ciencias medioambientales y de produción de biocombustibles. Entre ellas análisis de microbiomas con proximaciones de metagenómica shotgun o de amplicones (16S, 18S, ITS) que permiten estudiar cambios en el microbioma producidos por la contaminación, cambios estacionales, buscar nuevos organismos para la lucha contra plagas con medios biológicos, análisis de aguas, análisis en plantas de tratamiento de aguas residuales o para estudiar la composición del suelo.
Para el sector de biocombustibles ofrecemos estudios de microbiomas para buscar actividades enzimáticas específicas de interés, secuenciación y caracterización de genomas de hogos o de bacterias utilizadas en el proceso de producción de biocombustibles.